Optimisation of Xenium automated in situ sequencing for PAXgene-fixed tissue samples
Diese Studie stellt einen optimierten Workflow vor, der ein neuartiges, auf Pepsin basierendes Verdauungsprotokoll (XTO) nutzt, um die automatisierte Xenium-In-situ-Sequenzierungsplattform erfolgreich für PAXgene-fixierte Gewebe anzupassen, und zeigt, dass diese Proben eine räumliche RNA-Transkriptdetektion erreichen können, die mit der von Standard-FFPE-Proben vergleichbar ist oder diese sogar übertrifft, während die Gewebemorphologie erhalten bleibt.